1、含义不同：全额拨款指所需的事业经费全部由国家预算拨款，而差额拨款是按照差额比例，由国家和单位共同承担。2、稳定性不同：比起差额拨款来说，全额拨款相对稳定；而差额拨款存在的变动可能性很大，还存在很多不确定因素。3、范围不同：实行全额拨款的主要有图书馆、文化馆等单位，而差额拨款的单位有医院等。